Для того, чтобы реализаций основных функций Аппаратом Правительства РФ было эффективной, структура Аппарата Правительства РФ включает в себя:

- руководство Аппарата Правительства РФ;

- подразделения Аппарата Правительства РФ: департаменты Правительства РФ (в их составе создаются отделы) и секретариаты заместителей председателя Правительства РФ и руководителя Аппарата Правительства РФ (п. 5 Положения об Аппарате Правительства РФ).

В структуре Аппарата Правительства РФ действует на постоянной основе аппарат Военно-промышленной комиссии при Правительстве РФ, обеспечивающий ее деятельность и деятельность научно-технического совета Военно-промышленной комиссии при Правительстве РФ. В штатное расписание подразделений Аппарата Правительства РФ включаются должности, предусмотренные утвержденным в установленном порядке Реестром должностей федеральной государственной гражданской службы. Кроме того, в указанное штатное расписание могут включаться должности, не относящиеся к должностям федеральной государственной гражданской службы. Штатная численность Аппарата Правительства РФ на 2012 год составила 1242 ед. Работа Аппарата Правительства организуется в соответствии с Регламентом Правительства РФ, Положением об Аппарате Правительства РФ, Инструкцией по делопроизводству в Аппарате Правительства РФ, а также с утвержденными Руководителем Аппарата Правительства РФ основными вопросами сфер ведения департаментов, приказами и поручениями Руководителя Аппарата Правительства РФ.

Руководитель Аппарата Правительства назначается Президентом РФ по представлению председателя Правительства РФ (п. 8 раздела III Положения об Аппарате Правительства РФ). В настоящее время, как уже было отмечено выше, руководитель Аппарата Правительства является также заместителем председателя Правительства РФ. Руководитель Аппарата Правительства РФ имеет 12 заместителей, курирующих различные вопросы деятельности Правительства РФ. На сегодня это: Акимов Максим Алексеевич; Боровков Игорь Владимирович - руководитель аппарата Военно-промышленной комиссии при Правительстве РФ; Ентальцева Марина Валентиновна - руководитель протокола Председателя Правительства РФ; Забарчук Евгений Леонидович; Левицкая Александра Юрьевна - первый заместитель руководителя Аппарата Правительства РФ; Лобанов Иван Васильевич; Логинов Андрей Викторович; Молчанов Денис Владимирович; Найговзина Нелли Борисовна; Приходько Сергей Эдуардович - первый заместитель руководителя Аппарата Правительства РФ; Тимакова Наталья Александровна - пресс-секретарь председателя Правительства РФ; Тринога Михаил Иванович - руководитель Секретариата Председателя Правительства РФ. Согласно п. 10 Положения об Аппарате Правителсьтва РФ, заместители Руководителя Аппарата Правительства РФ координируют и контролируют работу департаментов Правительства РФ, организуют проработку проектов актов и других документов, по которым требуется решение Правительства РФ, подготовку материалов к заседаниям Правительства и его Президиума, осуществляют другие функции по руководству Аппаратом Правительства РФ в соответствии с распределением обязанностей и поручениями Руководителя Аппарата Правительства РФ.

В случае временного отсутствия Руководителя Аппарата Правительства РФ по его указанию обязанности Руководителя Аппарата Правительства РФ исполняет его заместитель.

Анализ норм п. 9 Положения об Аппарате Правительства РФ, позволяет условно классифицировать полномочия Руководителя Аппарата Правительства РФ по предмету регулирования. В первую группу можно включить те полномочия, которые направлены непосредственно на организацию работы Председателя Правительства РФ, в рамках которых Руководитель Аппарата Правительства РФ: - докладывает Председателю Правительства РФ материалы с проектами актов, по которым требуется решение Правительства РФ, и иных документов с соответствующими предложениями по результатам их подготовки Аппаратом Правительства РФ к рассмотрению в Правительстве РФ; - представляет Председателю Правительства РФ предложения о структуре, предельной численности работников Аппарата Правительства РФ; - ведет график работы Председателя Правительства РФ; - организует работу по подготовке совещаний, проводимых Председателем Правительства РФ, его докладов и выступлений, а также иных необходимых аналитических и справочных материалов; - обеспечивает своевременное представление Председателю Правительства РФ подготовленных в Аппарате Правительства РФ проектов поручений и иных материалов, по которым требуется решение Председателя Правительства РФ; - анализирует корреспонденцию, поступающую на имя Председателя Правительства РФ, докладывает ему соответствующие материалы и направляет корреспонденцию в установленном порядке в соответствии с распределением обязанностей в секретариаты Первого заместителя и заместителей Председателя Правительства РФ или для рассмотрения в департаменты.

Вторую группу полномочий составляют полномочия Руководителя Аппарата Правительства РФ в сфере назначений: именно он представляет Председателю Правительства РФ предложения о назначении на должность и освобождении от должности Правительством РФ заместителей Руководителя Аппарата Правительства РФ, директоров департаментов, руководителя Секретариата Руководителя Аппарата Правительства РФ, руководителя и заместителей руководителя Секретариата Председателя Правительства РФ, помощников и референтов Председателя Правительства РФ, а также вносит по представлениям Первого заместителя Председателя Правительства РФ и заместителей Председателя Правительства РФ предложения о назначении на должность и об освобождении от должности Правительством РФ руководителей их секретариатов.

Третья группа полномочий Руководителя Аппарата Правительства РФ может быть условно названа «внутриорганизационными», реализуя которые он: - организует деятельность Аппарата Правительства РФ и несет ответственность за выполнение возложенных на Аппарат Правительства РФ функций; - формирует в установленном порядке проекты плана заседаний Правительства РФ на очередной период и повесток заседаний Правительства; - распределяет обязанности между заместителями Руководителя Аппарата Правительства РФ; - устанавливает порядок работы подразделений Аппарата Правительства, а также определяет вопросы, входящие в сферу ведения департаментов; - утверждает штатную численность подразделений Аппарата Правительства РФ; - заключает контракты и трудовые договоры, а также в установленном законодательством РФ о федеральной государственной гражданской службе порядке назначает на должность и освобождает от должности по представлению директора департамента, руководителя секретариата федеральных государственных гражданских служащих и других сотрудников соответствующего подразделения Аппарата Правительства РФ; - решает вопросы, связанные с прохождением федеральной государственной гражданской службы в Аппарате Правительства РФ, принимает решение о поощрении сотрудников Аппарата Правительства и применении к ним мер дисциплинарного взыскания, обеспечивает профессиональную переподготовку и повышение квалификации сотрудников Аппарата Правительства РФ.

Полномочия последней группы мы условно обозначили как «нормотворческие». Реализуя их, Руководитель Аппарат Правительства РФ: - издает приказы и дает поручения по вопросам работы Аппарата Правительства РФ; - рассматривает внесенные в Правительство РФ проекты федеральных законов, актов Президента РФ, актов Правительства, другие поступившие документы и направляет их в подразделения Аппарата Правительства РФ для подготовки к рассмотрению в Правительстве РФ; - направляет в установленном порядке проекты соответствующих документов на согласование в Администрацию Президента РФ и для рассмотрения в федеральные министерства, федеральные службы и федеральные агентства, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство РФ.

Вне предложенной классификации следует назвать полномочия по определению порядка взаимодействия с представителями средств массовой информации, правила публичных выступлений работников Аппарата Правительства РФ и предоставления служебной информации. Кроме того, согласно подп. п) п. 9 раздела III Положения об Аппарате Правительства РФ, Руководитель Аппарата Правительства РФ осуществляет другие полномочия в соответствии с решениями Правительства РФ и поручениями Председателя Правительства РФ.

В соответствии с нормами п. 3 Положения об Аппарате Правительства Российской Федерации, Аппарат Правительства РФ взаимодействует с Администрацией Президента РФ, аппаратами Государственной Думы и Совета Федерации Федерального Собрания РФ и обеспечивает совместно с органами исполнительной власти и другими государственными органами реализацию полномочий Правительства. Нормами Постановления Правительства РФ от 26 ноября 2008 года № 888 «Об утверждении Регламента Государственной корпорации по атомной энергии «Росатом» (в ред. Постановлений Правительства РФ от 29.11.2011 № 989, от 01.11.2012 № 1118) Положение было дополнено п. 3.1. «Взаимодействие Аппарата Правительства с Государственной корпорацией по атомной энергии «Росатом» осуществляется в соответствии с настоящим Положением, если иные правила не установлены актами Президента Российской Федерации и Правительства».

Для реализации данного положения о взаимодействии в структуру Аппарата Правительства РФ включены также полномочные Представители Правительства РФ в органах государственной власти: Полномочные представители Правительства РФ в Совете Федерации, в Государственной Думе, в Конституционном суде РФ, Верховном суде РФ и Высшем арбитражном суде РФ (подробнее - радел 2.3. работы).

Согласно п. 11 Положения об Аппарате Правительства РФ, Департаменты Правительства РФ осуществляют свои функции в соответствии с названным Положением и утвержденными Руководителем Аппарата Правительства основными вопросами сфер ведения департаментов. В соответствии с п. 12 Положения Аппарате Правительства РФ, Департамент Правительства РФ обеспечивает деятельность Правительства РФ, его Президиума, а также Аппарата Правительства РФ по вопросам, входящим в сферу его ведения, и взаимодействует с соответствующими федеральными министерствами, федеральными службами и федеральными агентствами, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство РФ, с другими государственными органами и организациями.

В соответствии с п. 13 Положения Аппарате Правительства РФ, Департамент Правительства в пределах установленной сферы ведения осуществляет следующие функции: - подготавливает для рассмотрения внесенные в Правительство РФ проекты актов, по которым требуется решение Правительства РФ; - подготавливает проекты поручений Председателя Правительства РФ, Первого заместителя и заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ; - обеспечивает контроль за выполнением решений Правительства, поручений Председателя Правительства РФ, Первого заместителя и заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ; - подготавливает материалы и оформляет решения, принимаемые на совещаниях, проводимых Председателем Правительства РФ; - участвует в подготовке соответствующими секретариатами материалов и оформлении решений, принимаемых на совещаниях, проводимых Первым заместителем и заместителями Председателя Правительства РФ (в соответствии с распределением обязанностей) и Руководителем Аппарата Правительства РФ; - обеспечивает Председателя Правительства РФ, Первого заместителя и заместителей Председателя Правительства и Руководителя Аппарата Правительства необходимыми аналитическими и информационными материалами; - подготавливает проекты актов для их внесения в Правительство Председателем Правительства РФ, Первым заместителем и заместителями Председателя Правительства РФ (в соответствии с распределением обязанностей) и Руководителем Аппарата Правительства РФ; - осуществляет организационно-техническое обеспечение заседаний Правительства РФ, организует документооборот и ведение архива в Аппарате Правительства РФ, а также представление соответствующей информации о деятельности Правительства РФ; - осуществляет в установленном порядке материально-техническое обеспечение деятельности Аппарата Правительства РФ и социально-бытовое обслуживание работников; - осуществляет другие возложенные на него функции.

В соответствии с нормами п. 14 Положения об Аппарате Правительства РФ, Директор департамента Правительства РФ назначается на должность и освобождается от должности Правительством РФ и подчиняется Руководителю Аппарата Правительства РФ. Директор департамента Правительства РФ: - осуществляет непосредственное руководство департаментом и несет персональную ответственность за выполнение возложенных на департамент функций и состояние исполнительской дисциплины; - рассматривает внесенные в Правительство РФ проекты актов и другие документы по вопросам, входящим в сферу ведения департамента, визирует указанные проекты и подписывает экспертные заключения на них; - участвует в заседаниях Правительства РФ и его Президиума, совещаниях у Председателя Правительства РФ, и заместителей Председателя Правительства РФ, заседаниях правительственных и межведомственных комиссий, советов и оргкомитетов, совещаниях у Руководителя Аппарата Правительства РФ и его заместителей, проводимых по вопросам, входящим в сферу ведения департамента; - по поручению Председателя Правительства РФ, Первого заместителя и заместителей Председателя Правительства РФ, Руководителя Аппарата Правительства РФ или его заместителей участвует в заседаниях коллегиальных органов федеральных министерств, федеральных служб и федеральных агентств, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство РФ; запрашивает у органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, других организаций материалы, необходимые для анализа и подготовки вопросов, рассматриваемых в Правительстве РФ; - привлекает при необходимости в установленном порядке для проработки вопросов, рассматриваемых в Правительстве РФ, представителей органов исполнительной власти, научных учреждений и других организаций; - направляет на рассмотрение в соответствующие федеральные министерства, федеральные службы и федеральные агентства, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство, документы, поступившие в Правительство от органов государственной власти и органов местного самоуправления, иных органов и организаций, по которым не требуется решения Правительства, или возвращает отправителям документы, внесенные в Правительство с отступлением от правил, установленных Регламентом Правительства РФ; - распределяет обязанности между сотрудниками департамента; - представляет Руководителю Аппарата Правительства РФ предложения о назначении на должность и об освобождении от должности, о повышении квалификации, поощрении сотрудников департамента и наложении на них взысканий.

Заместители директора департамента обеспечивают организацию работы по выполнению функций департамента в установленной сфере деятельности в соответствии с распределением директором департамента обязанностей между ним и его заместителями (п. 16 Положения об Аппарате Правительства РФ). В случае временного отсутствия директора департамента его обязанности исполняет один из его заместителей. Должностные обязанности начальника отдела департамента, референта департамента, заместителя начальника отдела департамента, главного советника, советника, главного консультанта, консультанта, специалиста-эксперта, ведущего специалиста 1 разряда, ведущего специалиста 2 разряда, старшего специалиста 1 разряда и старшего специалиста 2 разряда содержатся в должностных регламентах, утверждаемых директором департамента. Сотрудники Аппарата Правительства при осуществлении функций, возложенных на соответствующие подразделения, руководствуются Регламентом Правительства РФ, Положением об Аппарате Правительства РФ, Инструкцией по делопроизводству в Аппарате Правительства РФ и утвержденными в установленном порядке должностными регламентами.

В систему подразделений Аппарата Правительства РФ входят Секретариаты: Секретариат РФ Дмитрия Анатольевича Медведева; Секретариат первого заместителя председателя Правительства РФ Игоря Ивановича Шувалова, а также Секретариаты 6 заместителей Председателя Правительства РФ: Ольги Юрьевны Голодец, Аркадия Владимировича Дворковича, Дмитрия Николаевича Козака, Дмитрия Олеговича Рогозина, Владислава Юрьевича Суркова, Александра Геннадиевича Хлопонина (Полномочный Представитель Президента РФ в Северо-Кавказском федеральном округе).

Согласно п. 18 Положения об Аппарате Правительства РФ, Секретариаты Председателя Правительства РФ и заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ организационно обеспечивают деятельность соответственно Председателя Правительства РФ, Первого заместителя Председателя Правительства, заместителей Председателя Правительства и Руководителя Аппарата Правительства. Секретариат Председателя Правительства РФ в целях организационного обеспечения деятельности Председателя Правительства РФ: представляет Председателю Правительства РФ аналитические, справочные и другие материалы по вопросам, рассматриваемым на заседаниях Правительства РФ и его Президиума, заседаниях координационных и совещательных органов, возглавляемых Председателем Правительства РФ, а также материалы для других мероприятий с участием Председателя Правительства РФ; обеспечивает своевременное представление Председателю Правительства РФ подготовленных проектов актов, поручений и иных материалов, по которым требуется решение Председателя Правительства РФ; участвует совместно с департаментами Правительства РФ в подготовке материалов к докладам и выступлениям Председателя Правительства РФ, аналитических и справочных материалов для Председателя Правительства РФ; обеспечивает по указанию Председателя Правительства РФ оперативное взаимодействие с руководителями федеральных министерств, федеральных служб и федеральных агентств, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство РФ, других органов и организаций, а также докладывает Председателю Правительства РФ оперативную информацию.

Секретариаты Первого заместителя Председателя Правительства РФ, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства в соответствии с п. 18, 19 Положения об Аппарате Правительства РФ: подготавливают совместно с департаментами Правительства РФ и представляют Первому заместителю Председателя Правительства РФ, его заместителям и Руководителю Аппарата Правительства РФ аналитические, справочные и другие материалы по вопросам, рассматриваемым на заседаниях Правительства РФ и его Президиума, заседаниях координационных и совещательных органов, возглавляемых Первым заместителем, заместителями Председателя Правительства РФ (в соответствии с распределением обязанностей) и Руководителем Аппарата Правительства РФ, а также материалы для других мероприятий с участием Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ; организуют проведение совещаний у Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ, а также оформляют с участием департаментов Правительства РФ решения, принятые на этих совещаниях; организуют совместно с подразделениями Аппарата Правительства РФ проведение и протокольное обеспечение других мероприятий, осуществляемых Первым заместителем, заместителями Председателя Правительства РФ и Руководителем Аппарата Правительства РФ; анализируют корреспонденцию, поступающую на имя Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ, докладывают им соответствующие материалы и направляют корреспонденцию в установленном порядке в соответствии с распределением обязанностей в секретариаты или для рассмотрения в департаменты; обеспечивают своевременное представление Первому заместителю, заместителям Председателя Правительства РФ и Руководителю Аппарата Правительства РФ подготовленных в Аппарате Правительства РФ проектов поручений и иных материалов, по которым требуется решение Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ (в соответствии с распределением обязанностей) и Руководителя Аппарата Правительства РФ; подготавливают для Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ материалы к их докладам и выступлениям, а также с участием других подразделений Аппарата Правительства РФ - необходимые аналитические и справочные материалы; обеспечивают по указанию Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ оперативное взаимодействие с руководителями федеральных министерств, федеральных служб и федеральных агентств, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ или Правительство РФ, других органов и организаций; докладывают Первому заместителю, заместителям Председателя Правительства РФ и Руководителю Аппарата Правительства РФ оперативную информацию; выполняют поручения Первого заместителя, заместителей Председателя Правительства РФ и Руководителя Аппарата Правительства РФ, а также контролируют выполнение их указаний.

Руководители секретариатов осуществляют непосредственное руководство этими подразделениями, несут персональную ответственность за выполнение возложенных на секретариаты функций, организуют работу сотрудников этих подразделений. Заместители руководителей секретариатов в соответствии с распределением обязанностей между руководителями секретариатов и их заместителями обеспечивают выполнение секретариатами функций, установленных анализируемым Положением.

В случае временного отсутствия руководителя секретариата его обязанности исполняет один из заместителей руководителя секретариата. Помощники и референты Председателя Правительства РФ взаимодействуют с подразделениями Аппарата Правительства РФ, ведут аналитическую работу, выполняют другие обязанности, возложенные на них Председателем Правительства РФ.